Existe una serie de contradicciones y posturas con relación a la conservación y protección de los "Humedales de Ite" al interior del Gobierno Regional de Tacna, si bien los consejeros regionales que visitaron los "Humedales de Ite", encontraron presencia de aves muertas fruto de la contaminación minera, existe una posición contraria de la Gerencia de Recursos Naturales del GRT, que desmiente esta afirmación de los consejeros tras indicar que no existe contaminación en esta zona ecológica.
El informe 050-2010, presentado por la Bióloga, Giovanna Chipana Incacuña, responsable del proyecto "Desarrollo de Capacidades para la Conservación de la Flora y Fauna Amenazada en la Región Tacna", presentada al gerente de Recursos Naturales, Ralfo Liendo, da a conocer algunas aseveraciones que discurren de la realidad sobre los humedales.
Por ejemplo en el mencionado documento se indica que el ecosistema de los "Humedales de Ite", serían artificiales, entre otras afirmaciones como que en la zona ecológica no habría presencia de aves muertas, y que los humedales serían de propiedad de la empresa minera Southern Perú, hecho que se contradice tras mencionar que se está trabajando para designar a los "Humedales de Ite", como área de conservación regional.
Así mismo en la elaboración del expediente técnico usado para este proyecto, carecería de información comprobada, "La formación del humedal sobre un sustrato inadecuado (relaves mineros) no parece afectar a las poblaciones de aves acuáticas", son algunas afirmaciones halladas en este análisis realizado en el GRT.
Este informe es sustentado por el gerente Ralfo Liendo durante la sesión de consejo regional, que viene debatiendo la problemática en la que se encuentra los "Humedales de Ite", se espera la respuesta de los consejeros del Gobierno Regional de Tacna.