El Gobierno Regional de Moquegua se encuentra en los últimos lugares de avance presupuestal a nivel nacional, ocupando el puesto 23° de 26° entidades, según el portal de transparencia «Consulta Amigable» del Ministerio de Economía y Finanzas (MEF). Solo supera a los gobiernos regionales de Lima y Pasco, y a la Municipalidad Metropolitana de Lima.
Con apenas un 66.5% de avance presupuestal devengado del Presupuesto Institucional Modificado (PIM) de 715 millones de soles, Moquegua está por detrás de sus regiones vecinas. Tacna, con un 72.9% de avance, ocupa el 8° lugar en el ranking, Arequipa con un 72.8% está en el 9°, y Puno, con un 68.9%, se ubica en el 20° puesto.
